王亦生老師具多年研發陣列質譜儀、溫控式多極離子阱、傅利業離子迴旋共振質譜儀等技術之經驗，並將其技術用以研究氣態離子光譜，以及其反應動力學。

他所帶領的研究團隊，首創唯一可以用於檢測凝態樣品的同步雙電性質譜技術，可以應用於現代質譜儀上最重要的基質輔助雷射脫附游離法(matrix-assisted laser desorption/ionization) 與電噴灑離子化法 (electrospray ionization)。對於複雜生物樣本與影像質譜檢測等，不適合重複分析的樣品而言，他的創新發明，具有特別的意義與貢獻。

該團隊並且針對MALDI反應機制做整合性的研究，期能增加質譜儀的靈敏度，並針對游離效率低的醣分子進行游離法的研究。

王亦生老師已於台灣質譜學會第八屆年會，受頒2011青年學者研究獎。